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Sanger酶法DNA序列分析

来源:上海士锋生物科技有限公司2024/9/15 7:12:075
导读:

一、试剂

1 、 10 × TBE ( pH 8.3 ):

2 、 46% 尿素溶液:

3 、 20% 聚丙烯酰胺溶液

4 、 10% 过硫酸胺

5 、引物

6 、模板

7 、 DNA 聚合酶

8 、放射性标记的 dNTP 和 ddNTP 贮存液

9、TEMED

二、操作方法

(一)由双链质粒制备单链DNA膜板

取质粒 DNA (溶于双离蒸去离子水中) 8μl ( 1.5 ~ 2ug )

加 2mol NaOH 2ul ,混匀后稍加离心,置室温 10min

加 3mol 乙酸钠( pH5.2 ) 3μl

双蒸去离子水 7μl

无水乙醇 60μl

置液氮 10min ,离心 10min ( 13krpm ),

加 70%乙醇洗1次,离心 ( 13krpm )

弃上清,真空抽干,溶于 10ul双 蒸去离子水中

取样,电泳鉴定

(二)聚丙烯酰胺/尿素胶制备:

将玻板洗净,拭干; 70% 乙醇洗,凉干;内层涂硅油,

重蒸水洗净,吹干

混合: 20% 聚丙烯酰胺液 20ml

10 × TBE 5ml

46%尿素 25ml

总计40ml过滤纸滤过

加 10%过硫酸胺(AP)250μl;用双蒸去离子水定容至100ml,混匀

倒胶前加入 TEMED 50μl,混匀

灌胶,待凝胶聚合后,将测序胶板安装于测序电泳槽中

电泳槽中加入 800ml1 × TBE

预电泳

(三)DNA序列反应:

模板 DNA 10μl ; 4 只离心管上标记

引物 2μl G 、 A 、 T 、 G 各管中

退火缓冲液 2μl 分别加入 2.5ul 的 ddNTP

总体积 14μl 终止混合液,盖好盖子。

↓ ↓

60℃ 10min 变性 37℃孵育1min

↓ ↓

标记混合物 3μl

α-32P-dATP 1μl

稀释的DNA聚合酶2μl

混匀后置室温5min

每个反应管4.5μl ↓

↓--------------------------------

37℃ 5min温浴

每管加入5μl 终止液

混匀,置冰上

上样前75~80℃

混匀,置冰上

上样前75℃~85℃加热2min,随即上样

依次为A、G、C、T,每孔上样2~3μl

40W恒功率下电泳,至溴酚蓝走到底

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