一、试剂
1 、 10 × TBE ( pH 8.3 ):
2 、 46% 尿素溶液:
3 、 20% 聚丙烯酰胺溶液
4 、 10% 过硫酸胺
5 、引物
6 、模板
7 、 DNA 聚合酶
8 、放射性标记的 dNTP 和 ddNTP 贮存液
9、TEMED
二、操作方法
(一)由双链质粒制备单链DNA膜板
取质粒 DNA (溶于双离蒸去离子水中) 8μl ( 1.5 ~ 2ug )
↓
加 2mol NaOH 2ul ,混匀后稍加离心,置室温 10min
↓
加 3mol 乙酸钠( pH5.2 ) 3μl
双蒸去离子水 7μl
无水乙醇 60μl
↓
置液氮 10min ,离心 10min ( 13krpm ),
↓
加 70%乙醇洗1次,离心 ( 13krpm )
↓
弃上清,真空抽干,溶于 10ul双 蒸去离子水中
↓
取样,电泳鉴定
(二)聚丙烯酰胺/尿素胶制备:
将玻板洗净,拭干; 70% 乙醇洗,凉干;内层涂硅油,
重蒸水洗净,吹干
↓
混合: 20% 聚丙烯酰胺液 20ml
10 × TBE 5ml
46%尿素 25ml
总计40ml过滤纸滤过
↓
加 10%过硫酸胺(AP)250μl;用双蒸去离子水定容至100ml,混匀
↓
倒胶前加入 TEMED 50μl,混匀
↓
灌胶,待凝胶聚合后,将测序胶板安装于测序电泳槽中
↓
电泳槽中加入 800ml1 × TBE
↓
预电泳
(三)DNA序列反应:
模板 DNA 10μl ; 4 只离心管上标记
引物 2μl G 、 A 、 T 、 G 各管中
退火缓冲液 2μl 分别加入 2.5ul 的 ddNTP
总体积 14μl 终止混合液,盖好盖子。
↓ ↓
60℃ 10min 变性 37℃孵育1min
↓ ↓
标记混合物 3μl
α-32P-dATP 1μl
稀释的DNA聚合酶2μl
↓
混匀后置室温5min
↓
每个反应管4.5μl ↓
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37℃ 5min温浴
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每管加入5μl 终止液
↓
混匀,置冰上
↓
上样前75~80℃
↓
混匀,置冰上
↓
上样前75℃~85℃加热2min,随即上样
↓
依次为A、G、C、T,每孔上样2~3μl
↓
40W恒功率下电泳,至溴酚蓝走到底
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