多克隆抗体就是用一种包含多种抗原决定簇的抗原免疫动物，刺激机体多个B细胞克隆产生针对多种抗原表位的不同抗体后，所获得的免疫血清实际上是含有多种抗体的混合物。由一种抗原决定簇刺激机体，由一个B淋巴细胞接受该抗原刺激所产生的抗体称之为单克隆抗体。由多种抗原决定簇刺激机体，相应地就产生各种各样的单克隆抗体，这些单克隆抗体混杂在一起就是多克隆抗体。
多克隆抗体与单克隆抗体的应用比较
（1）多克隆抗体的应用
一种良好的多克隆抗血清含有抗某种抗原不同表位的多种抗体。由于多克隆抗血清通常包含抗某一抗原的不同表位的抗体，包括变性—抗性的表位，所以，在深固定的样本中也会发挥效应，在石蜡包埋组织切片的染色中，多克隆抗体常选用。根据实验的不同需要，多克隆抗体应用于相应抗原的标记。此外，在农业生产中，多克隆抗体被用于农药残留现场监测；在临床应用中，多克隆抗体主要用于病原物的检测、疾病的诊断及治疗，如作为蛋白类免疫抑制剂用于移植反应和自身免疫病的治疗。
（2）单克隆抗体的应用
单克隆抗体可用于分析抗原的细微结构及检验抗原抗体未知的结构关系；生产出针对复杂生物混合物中的特定分子的抗体，可用于分离、分析及纯化该特定分子抗原；其试剂可用于临床诊断和治疗，或用于以单抗为弹头的药物，直接导向肿瘤等。自Mathe于1958年*将抗鼠白血病免疫球蛋白与氨甲喋呤(MTX)交联用于导向治疗以来，相继出现了多种*药物与各种抗体的免疫耦合物，药物与单抗直接交联、药物通过小分子交联剂与单抗连接及药物通过大分子载体与单抗相连形成免疫耦合物，促进了分子导向药物的研制工作从实验室走向临床并广泛应用于疾病治疗。
多克隆抗体与单克隆抗体的制备比较
多克隆抗体制备的主要流程包括：①制备抗原；②选择实验动物；③动物免疫；④试取血进行测试，看看是否成功免疫；⑤如果成功免疫，处死实验动物，采集全部血清；⑥纯化出抗体；⑦鉴定抗体，包括纯度以及特异性。
与单抗制备的区别 经过特定抗原处理过的B淋巴细胞与骨髓瘤细胞通过细胞融合的方法得到杂交瘤细胞，经HAT培养基筛选、ELISA检测效价后就得到阳性克隆株，后进行细胞培养或将细胞注入到动物（一般为balb/c小鼠）腹腔中用腹水培养，收集上清/腹水纯化后就能得到单克隆抗体。而制备多克隆抗体就没有单克隆抗体繁琐，只需将抗原（纯度越高越好）直接注入到动物体内进行免疫，经过3至4次免疫，ELISA测其效价合格后，收集血液离心得到上清，纯化后即能得到多克隆抗体。因此多抗制备的周期就比单抗制备的短，*制备价格也比单抗要低。