详情

饲用酶工程团队开发出提高糖苷水解酶催化效率的新策略

来源:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 编辑: 田健2023/10/25 8:46:09151
导读
实验结果表明,CHIS1754- MUT7的催化效率( k cat/ K m)是野生型的23.53倍。该蛋白理性策略计算效率高,实验成本低,具有显著的优势,为酶催化效率的智能设计提供了一种新的途径,具有广泛的应用前景。
  近日,中国农业科学院北京畜牧兽医研究所姚斌院士团队和中国农业科学院生物技术研究所微生物蛋白设计与智造创新团队合作,开发了基于深度神经网络和分子进化分析,提高糖苷水解酶催化活性的新策略。相关研究成果发表在《科学通报 (Science Bulletin)》。
 
  糖苷水解酶是降解多糖的主要酶系,在食品行业、饲料行业、农副产品加工和农副产品废品降解等领域应用广泛,具有重要的应用价值。市场对糖苷水解酶的需求量逐年增加,但提高糖苷水解酶的催化效率,发挥其最大催化潜力仍然是一个挑战。
 
  该研究首先从碳水化合物活性酶数据库(Carbohydrate-Active enZYmes Database, CAZy)数据库中收集整理了119个糖苷水解酶家族的蛋白序列,建立了能够识别糖苷水解酶家族和功能残基的深度学习模型DeepGH,通过10倍交叉验证结果显示DeepGH模型的预测准确率为96.73%。随后利用梯度加权类激活图谱(Gradient-weighted Class Activation Mapping, Grad-CAM)方法提取分类相关特征,结合序列进化信息对突变体进行设计,最后获得了具有7个氨基酸突变位点的壳聚糖酶突变体CHIS1754-MUT7。实验结果表明,CHIS1754- MUT7的催化效率( k cat/ K m)是野生型的23.53倍。该蛋白理性策略计算效率高,实验成本低,具有显著的优势,为酶催化效率的智能设计提供了一种新的途径,具有广泛的应用前景。
 
  中国农业科学院北京畜牧兽医研究所黄火清研究员、田健研究员和中国农业科学院生物技术研究所关菲菲副研究员为论文共同通讯作者,中国农业科学院生物技术研究所刘汗青、关菲菲、刘拓宇和杨丽鑫为论文共同第一作者。【阅读原文】 

 作者:田健

版权与免责声明:凡本网注明“来源:兴旺宝”的所有作品,均为浙江兴旺宝明通网络有限公司-兴旺宝合法拥有版 权或有权使用的作品,未经本网授权不得转载、摘编或利用其它方式使用上述作品。已经本网授权使用作品的,应在授权范围内使用,并注明“来源:兴旺宝”。违反上述声明者,本网将追究其相关法律责任。 本网转载并注明自其它来源(非兴旺宝)的作品,目的在于传递更多信息,并不代表本网赞同其观点或和对其真实性负责,不承担此类作品侵权行为的直接责任及连带责任。其他媒体、网站或个人从本网转载时,必须保留本网注明的作品第一来源,并自负版权等法律责任。 如涉及作品内容、版权等问题,请在作品发表之日起一周内与本网联系,否则视为放弃相关权利。

展开全部
热门评论