牛奶杀菌锅在控制方面，选用可编程序来实施整个程序的自动控制。
① 温度控制：在调定值后，温度的显示误差为±0.5℃，它能保障加热均匀。
② 压力控制：在调定值后，压力的显示误差为±0.01㎏/cm,对于防止食品品质低劣包装物的变形、破损十分有益。
③ 液位控制：本套设备中的热水罐上配有三支电极棒，工艺罐上配有二支电极棒。它可控制容器内之液位，当水量达到预定水位时，能自动停泵或关泵，并发出信号或转入下一程序。
④ 工程进行：在加热过程中，均有时间的预定值。它由时间执行，罐内水的温度及压力均由蒸汽、压缩空气及时间等外部件来控制。故此不会出现差错。所以，根据不同制品的不同需要，只要设定出工程所需要的时间、温度和压力，直接利用触摸屏上相应的数字输入画面输入数据。
牛奶杀菌锅选择原则
1、主要从控温精度和热分布均匀性上进行选择，若产品要求温度很严格，尤其是出口产品，因为要求热分布很均匀，所以应尽量选择电脑全自动杀菌锅。电脑半自动杀菌锅温度控制、压力控制与电脑全自动相同，但是价格却是电脑全自动的1/3。一般要求可以选择电气半自动杀菌锅。手动杀菌锅杀菌难度高，控温和控压等都由人工完成，食品外观很难掌握，涨罐（袋）和破碎率高。
2、若产品是含气包装或者产品外观比较要求比较严格，则应选择电脑全自动或电脑半自动杀菌锅。
3、若产品是玻璃瓶或马口铁，因为升温和降温速度都要求可以控制，所以尽量不应选择双层杀菌锅。
4、若从节约能源考虑，可选择双层杀菌锅，其特点是上罐是热水罐，下罐是处理罐，上罐的热水重复使用，可节约大量蒸汽，适合每天产量超过10吨的食品生产企业。
5、若产量较小或者没有锅炉，则可以考虑使用电汽两用杀菌锅，其原理是蒸汽由下罐电加热产生，上罐灭菌。
6、若产品粘稠度很高，杀菌过程中产品需要旋转，则应选择选择旋转式杀菌锅。
