S固相萃取小柱的容量是指固相萃取柱填料的吸附量。对于以硅胶为基质的S固相萃取小柱，其容量一般在1~5mg/100mg，也就是柱容量是填料质量的1%~5%。而键合硅胶离子交换吸附剂填料的容量以meq/g表示，即每克填料的容量为X毫克当量。这类填料的容量通常在0.5~1.5meq/g。
    在选择S固相萃取小柱时，必须考虑柱容量。由于我们面对的样品基质通常都较为复杂，例如食品、生物样品等等，在固相萃取中，固相萃取吸附剂对目标化合物吸附的同时，也会吸附同类性质的杂质。因此，在考虑柱容量是应该是目标化合物加上可被吸附的杂质总量不能超过柱容量，否则在载样的过程中就可能有部分目标化合物不能被吸附，造成回收率偏低。