藻类分类计数仪采用了真彩高解析度CCD，流程化藻类分类计数软件和Algacount专家辅助鉴定技术。能自动连续获取生物显微镜的光学信号，并转化为显微数字图像，然后对每张图像的各种浮游藻进行分类计数标记，再通过对100个视野中分类标记的藻自动累计，实现藻密度的自动换算和优势种自动判定。
仪器还同时配备功能强大的Algacount专家辅助鉴定搜索库，含11门、350属、1500种藻类文字描述、特征图、及精美显微照片，使用者可以选择门、属、种，对藻类进行智能搜索。这项技术替代了常规藻类鉴定手册查阅，实现快速辅助鉴定藻种，确定其中文名称和拉丁名称，为环境监测、水质分析及藻类研究机构提供了操作平台，尤其适合基层实验人员的快速培训。
当前藻类监测的主要手段是：经典的显微鉴定计数法和进口的藻类在线分析仪。传统的显微鉴定计数法是通过生物显微镜连续镜检，工作强度大、效率低，同时要求实验人员必须具备丰富的水生生物学知识，能鉴定、识别常见藻类。而进口的藻类在线分析仪是基于藻的色素分析来确定藻的浓度，只能宏观地把藻分为四大类，根本无法精确地鉴定藻并计算藻密度。
我国的“水环境监测规范”要求：浮游植物定量计数必须鉴定到属；“近海污染生态调查和生物监测” 规定：优势种、常见种、赤潮生物种应鉴定到种。针对当前我国专业藻类监测技术手段的匮乏现状和人工镜检进行藻类监测的低效率，迅数科技融合国内外研发资源，历时2年，倾力推出了创新的Algacount TM藻类计数仪和藻类辅助鉴定计数仪。