杀菌剂厂家选择杀菌剂使用一定时间后，往往有抗药性，杀菌效果降低，这时应改为另一种杀菌剂，因此每种水应筛选两种杀菌剂。
         1、应注意选择价格便宜、运输方便、使用方便的杀菌剂。
         2、选择低毒无二次污染的杀菌剂。如二硫氰基甲烷杀菌剂不能用（５ｐｐｍ）。
         3、无论使用什么杀菌剂都要进行杀菌试验及配伍性试验。所取水样应有代表性，当水中含菌量不高时，可取回水样在一定有利于细菌繁殖的条件下进行培养，使菌量高时再作筛选试验用。

杀菌剂厂家投加：连续投加：控制细菌数量的增加 ；间歇冲击投加：大剂量投加杀灭大量细菌 ；两者结合。 加药点 ：一般设在污水处理系统的远端，如进站来水处（除油罐前）。 为确保注水水质，一般在污水处理的滤后或注水泵进口设加药点。 加药量 ：连续式投加：开始浓度较高 ，细菌数量控制下来后，采用相对较低的加药浓度。有效浓度由室内评价和现场细菌分析确定。

细菌数量监控污水处理系统加入杀菌剂后，要定期取样，按常规方法进行细菌计数，随时调整加药方式和加药浓度，确保杀菌剂杀菌效果。致力于多功能杀菌剂的研究。在密闭的油田污水注水处理系统中，添加以杀菌为主兼有缓蚀和(或)阻垢，或兼有絮凝和(或)缓蚀的多功能杀菌剂，通过一剂多能，大大提高综合处理效率，降低使用成本。